Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRBP1Q9P2E9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRBP1Q9P2E9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms