Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COMMD8Q9NX08 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms