Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOPCQ9HD26 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOPCQ9HD26 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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