Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms