Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RHOXF2Q9BQY4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms