Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CAVIN3Q969G5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms