Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HELBQ8NG08 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms