Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC149Q6ZUS6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms