Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00299Q6ZSB3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms