Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCBE1Q6UXH8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms