Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD40Q6AI12 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD40Q6AI12 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms