Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP188Q5SRE5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms