Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPANXN3Q5MJ09 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPANXN3Q5MJ09 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms