Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDLIM3Q53GG5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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