Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK4Q16099 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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