Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZIC1Q15915 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZIC1Q15915 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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