Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6AP1Q15904 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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