Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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BRD3Q15059 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BRD3Q15059 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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