Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SELENBP1Q13228 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms