Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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BNIP1Q12981 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BNIP1Q12981 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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