Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TWF1Q12792 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TWF1Q12792 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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