Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXO1Q12778 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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