Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIPPLY1Q0D2K3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms