Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IFFO1Q0D2I5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms