Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DHX9Q08211 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DHX9Q08211 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms