Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms