Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
GNB1P62873 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms