Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTCP1P56278 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms