Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TGM4P49221 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TGM4P49221 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms