Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRT6CP48668 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms