Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPDP35247 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms