Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCL1P22362 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCL1P22362 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCL1P22362 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms