Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ELK1P19419 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ELK1P19419 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms