Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATF1P18846 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATF1P18846 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms