Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BMP4P12644 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms