Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TIMM17BO60830 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TIMM17BO60830 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms