Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF22A3QJZ6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms