Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNX10Q9Y5X0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNX10Q9Y5X0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX10Q9Y5X0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX10Q9Y5X0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms