Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G4

PCDHGA9, Protocadherin gamma-A9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA9Q9Y5G4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA9Q9Y5G4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHGA9Q9Y5G4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGA9Q9Y5G4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms