Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRIM17Q9Y577 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM17Q9Y577 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM17Q9Y577 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM17Q9Y577 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM17Q9Y577 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM17Q9Y577 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM17Q9Y577 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM17Q9Y577 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM17Q9Y577 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms