Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y512

SAMM50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMM50Q9Y512 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SAMM50Q9Y512 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SAMM50Q9Y512 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SAMM50Q9Y512 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SAMM50Q9Y512 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms