Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAB1Q9Y478 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKAB1Q9Y478 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAB1Q9Y478 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms