Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR1DQ9Y2S0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1DQ9Y2S0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms