Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP11BQ9Y2G3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP11BQ9Y2G3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP11BQ9Y2G3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms