Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EFR3BQ9Y2G0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EFR3BQ9Y2G0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EFR3BQ9Y2G0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EFR3BQ9Y2G0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms