Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SSX2IPQ9Y2D8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSX2IPQ9Y2D8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSX2IPQ9Y2D8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SSX2IPQ9Y2D8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms