Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVW-1Q9UQF0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms