Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNRC6BQ9UPQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNRC6BQ9UPQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNRC6BQ9UPQ9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms