Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PHF8Q9UPP1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PHF8Q9UPP1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PHF8Q9UPP1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHF8Q9UPP1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PHF8Q9UPP1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PHF8Q9UPP1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHF8Q9UPP1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHF8Q9UPP1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms