Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPDR1Q9UM22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPDR1Q9UM22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EPDR1Q9UM22 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms